מטופלים החיים עם HIVי(Human immunodeficiency virus) נמצאים בסיכון מוגבר למחלת כליות כרונית (CKD – chronic kidney disease), המוגדרת לפי ירידה בשיעור הסינון הגלומרולרי המוערך (eGFR – estimated glomerular filtration rate). מחקרים קודמים הציעו כי שינויים אפיגנטיים יכולים להיות קשורים ל-CKD, עם זאת, המנגנון בו HIV קשור ל-CKD לא נחקר בצורה מעמיקה עד כה.
עוד בעניין דומה
החוקרים ביצעו מחקר אסוציאציה אפיגנומי של eGFR בקרב 567 גברים עם HIV חיובי ו-117 מטופלים עם HIV שלילי מתוך ה-Veterans Aging Cohort Study במטרה לזהות חתימות אפיגנטיות הקשורות לתפקוד כלייתי.
במחקר נבדקו יותר מ-400,000 אתרי CpGי(cytosine guanine dinucleotide) בתאים מונונוקלוארים מדגימות דם פריפרי. החוקרים הצליחו לזהות 15 אתרים עם קשר מובהק ל-eGFR (ערך Q לשיעור גילויים שגויים < 0.05) בקרב משתתפים עם HIV חיובי. אתרי ה-CpG המובהקים ביותר נמצאו ב-MAD1L1,יTSNARE1/BAI1 ו-LTV1, והראו כולם קשר שלילי עם eGFRי(cg06329547, P = 5.25 × 10–9 ; cg23281907, P = 1.37 × 10–8 ; cg18368637, P = 5.17 × 10–8). בנוסף, החוקרים שיחזרו אתרי CpG קשורים ל-eGFR שדווחו במחקרים קודמים כולל cg17944885 י(P = 2.5 × 10–5) הממוקם בין ZNF788 ו-ZNF20 על כרומוזום 19 באוכלוסיית המאגר.
החוקרים הצליחו לחשוף קשרים אפיגנטיים חדשים הקשורים לתפקודי כליות בקרב מטופלים עם HIV והציעו מנגנונים אפיגנטיים אפשריים הקשורים לסיכון של אותם מטופלים לפתח CKD.
מקור: